Cell Contrastive Learning in Imaging Flow Cytometry

Forschungsthema/Bereich
Bildverarbeitung
Typ der Abschlussarbeit
Bachelor / Master
Startzeitpunkt
30.11.0001
Bewerbungsschluss
31.03.2025
Dauer der Arbeit

Beschreibung

Imaging Flow Cytometry kombiniert die Leistungsfähigkeit der Hochdurchsatz-Durchflusszytometrie mit detaillierter Bildgebung, um einzelne Zellen in einem beispiellosen Ausmaß zu analysieren. Mit der Explosion von Daten, die diese Technik erzeugt, bietet „Self-supervised Learning“ einen innovativen Ansatz, um nicht beschriebene Daten zu nutzen und sinnvolle Muster und Einblicke, ohne umfangreiche manuelle Anmerkungen aufzudecken. Eine Möglichkeit hier ist „Contrastive Learning“ auf Zellebene zu untersuchen.

Aufgaben umfassen unter anderem:

Literaturrecherche zum Stand der Technik im Bereich „Representation Learning“ für Bilddaten
Verbesserung vorhandener Ansätze
Benchmarking unterschiedlicher Ansätze
Ablation Studien

Benefits:

Einarbeitung
Home-Office möglich
Sprache: Deutsch / Englisch

Voraussetzung

Voraussetzungen an Studierende
  • Studium in Informatik/Ingenieurwesen, Biomedizinische Technik oder verwandte Bereiche
  • Grundkenntnisse in Deep Learning und Bildverarbeitung
  • Erfahrung mit Programmierung in Python
  • Erfahrung mit Bildverarbeitungsbibliotheken in Python wie OpenCV.
  • Erfahrung mit Python-basierten Deep Learning Frameworks (PyTorch, JAX oder TensorFlow)

Studiengangsbereiche
  • Ingenieurwissenschaften
    Bioingenieurwesen
    Elektrotechnik & Informationstechnik
    Informatik
    Maschinenbau
    Mechatronik & Informationstechnik
    Mechanical Engineering
  • Naturwissenschaften und Technik
    Biologie
    Mathematik
    Technomathematik
    Medizintechnik


Betreuung

Titel, Vorname, Name
M. Sc. Angelo Jovin Yamachui Sitcheu
Organisationseinheit
Institut für Automation und angewandte Informatik
E-Mail Adresse
angelo.sitcheu@kit.edu
Link zur eigenen Homepage/Personenseite
Website

Bewerbung per E-Mail

Bewerbungsunterlagen
  • Lebenslauf
  • Notenauszug

E-Mail Adresse für die Bewerbung
Senden Sie die oben genannten Bewerbungsunterlagen bitte per Mail an angelo.sitcheu@kit.edu


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